滑膜囊肿不会发生癌变。因为滑膜囊肿本身是一种良性病变，最为多见的是膝关节的腘窝囊肿，还有其他部位的囊肿，如膝关节半月板囊肿，以及其他肩关节炎、肘关节炎导致的滑膜囊肿。
囊肿其实就是关节腔的关节液，从关节囊薄弱处突出，流到了关节外的部位，在关节外的肌肉间隙形成囊性包块，可以将上皮组织组成囊袋，都是由大量关节液组成。
关节液有些比较稀薄，有些稍黏稠，也比较常见，总体而言大部分都是液体性质，所以不是实质性的组织块。囊肿包括外面的囊壁，还有其中的关节液都是良性成分，都是人体的正常组织，而不是肿瘤，所以从性质上不会变成肿瘤。
手术治疗是将囊肿的包膜，包括其中的内容物完整的分离切除，根部做结扎、缝合，可以防止复发，切除彻底一般不会复发，更不会变成癌症。
滑膜囊肿与腱鞘囊肿如何鉴别
滑膜囊肿与腱鞘囊肿主要是根据两者的发病部位、发病原因、症状表现、治疗方式等方面来进行鉴别的。
1、发病部位：滑膜囊肿与腱鞘囊肿的原因都是外伤和慢性劳损，但是两者的发病部位是不一样的。滑膜囊肿发生在关节的滑膜部位，而腱鞘囊肿发生在肌腱比较集中的部位。
2、发病原因：滑膜囊肿主要是滑膜受到损伤或者是慢性损伤导致的。而腱鞘囊肿是因为关节囊、韧带及腱鞘部位过度使用或结缔组织营养不良导致的。
3、症状表现：滑膜囊肿患者一般有局部肿胀、疼痛、关节积液等症状，滑膜囊肿在早期就可以出现症状的。腱鞘囊肿早期症状并不明显，到了中后期才会被患者发觉。肌腱会出现肿块，这个肿块边缘比较光滑，且可以自由活动。
4、治疗方式：滑膜囊肿患者可以通过保守治疗的方式，比如超声波、热疗、冷疗等方法来治疗。也可以采用手术治疗，主要是从周边软组织部位剥离囊肿。腱鞘囊肿选择保守治疗的患者是通过消除囊肿，让身体自我吸收囊肿来进行治疗。手术治疗方法是通过切除囊肿来进行治疗。
